Занимаясь в области генной инженерии молодой профессор нашёл способ извлечения из человеческих органов загадочной субстанции "Душа". Она оказалось хорошим источником лечения.
Существовала всего одна маленькая проблема — люди, лишившиеся душ, становились зомби, и в их тела вселялись различные твари, получавшие возможность кардинально изменять сущность тела-носителя. Отсутствием души в теле одной из жертв эксперимента воспользовался Бафомет — демон из параллельного мира, который быстро основал культ Люцифера Светозарного. У культа была простая цель — открыть врата в параллельный мир и выпустить оттуда повелителя Люцифера. Количество людей, лояльных этому культу, начало катастрофически расти, сатанисты по всему миру присоединялись к Бафомету.
Главному герою игры "Чистильщик", молодому человеку по имени Стивен Гейст, плевать на быстрый рост числа поклонников сатаны. Его гораздо больше волнует судьба пропавшей подруги, которая за день до исчезновения встречалась с предводителем "Нового Рассвета" — тоталитарной секты, подчиненной сатанинскому культу. И Стивен начинает действовать...
С определенного момента он начинает представлять угрозу "Новому Рассвету" и становится для сатанистов и мишенью номер один.